Фамилия Лыгута звучит необычно для русского уха, и это подсказка: перед нами, скорее всего, украинская или белорусская фамилия. Её основа — слово «лигута» или «лыгута», которое в юго-западных говорах означало человека с длинными, тонкими ногами, «долговязого». В украинском языке есть родственное «лигий» — гибкий, тонкий, и «лигати» — болтаться, мотаться. Прозвище Лыгута могли дать нескладному, высокому парню или тому, кто ходил размашистой, неуклюжей походкой.

Суффикс -ута в этой фамилии — характерный признак украинской и белорусской ономастики. В русском языке такой суффикс встречается реже, а вот в малороссийских землях он активно образовывал прозвища и фамилии от глаголов и прилагательных (сравните: Кривута, Хижута, Бормотута). То есть Лыгута — это не притяжательная форма (не «чей-то сын»), а прямое прозвище, которое закрепилось за человеком и перешло к его потомкам без дополнительных суффиксов, как часто бывало на западе Российской империи.

По сословному составу Лыгуты, скорее всего, были крестьянами или казаками. Фамилии на -ута почти не встречаются среди дворянства, зато обычны в среде вольного или зависимого сельского населения. Если искать географию, то фамилия тяготеет к Правобережной Украине, Волыни, Гомельской области Беларуси и приграничным районам России (Брянщина, Курщина). В этих местах до сих пор встречаются носители фамилии, хотя в целом она редкая.

Написание через «ы» (Лыгута, а не Лигута) может указывать на влияние русского правописания или местных говоров, где «и» и «ы» не различались. В документах XIX века одну и ту же семью могли записать и как Лыгута, и как Лигута, но современная норма закрепила вариант через «ы». Это не меняет сути: прозвище было насмешливым, но беззлобным — так на селе цепляли меткие характеристики, которые потом становились фамилиями на века.