Фамилия Любуцин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от основы, оканчивающейся на гласный, с помощью суффикса -ин, указывающего на принадлежность («чей?» — Любуцин, то есть сын или потомок Любуцы). Эта модель типична для фамилий, возникших в северных и центральных регионах России, и является прямой параллелью к притяжательным прилагательным.

Исходное личное имя или прозвище — Любуца. Чаще всего его связывают с женским крестильным именем Любовь. В этом случае Любуца — уменьшительно-ласкательная форма, подобно тому как Мария превращается в Маруцу, а Анна — в Ануцу. Само имя Любовь, одно из трёх сестёр-мучениц Веры, Надежды и Любови, вошло в русский святцы после крещения Руси и означает «любимая». Покровительницей имени считается Любовь Римская, отроковица, пострадавшая за веру во II веке.

Есть и другая версия, не связанная с церковным именем. Любуцей могли прозвать человека в быту — от глагола «любить» или прилагательного «любый» (милый, дорогой). Такое прозвище могло закрепиться либо за симпатичным, приятным внешне человеком, либо за тем, кто отличался любящим, сердечным нравом. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных крестильных имён, фамилии на -ин от прозвищ и уменьшительных форм встречаются реже, что делает Любуцина особенно интересной для ономастики.

Сравните с однокоренными фамилиями: Любовцев, Любавин, Любушкин. Все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами и исходными формами. Любуцин стоит в этом ряду особняком, так как его основа — редкая уменьшительная форма, практически не сохранившаяся в современном русском языке в качестве самостоятельного имени. Это значит, что фамилия могла закрепиться в конкретной местности и передаваться в одном роду, не получив широкого распространения. Точно сказать, откуда пошёл род Любуциных — из крестьянской, купеческой или духовной среды — без генеалогического исследования трудно, но сама модель образования фамилии указывает на её древность: такие фамилии активно формировались в XV–XVII веках.