Фамилия Людижинские (в мужском роде — Людижинский) образована по типичной для восточнославянских земель модели с суффиксом -ск- и окончанием -ий/-ый, которая указывает на территориальную принадлежность. Такие фамилии чаще всего получали по названию местности, откуда был родом человек. Основа «Людиж-» почти наверняка восходит к топониму — селу или усадьбе с названием Людиж, Людижи или Людижино.

Корень «люд-» в славянских языках означает «народ», «люди». Название поселения могло быть связано с первыми жителями («люди», то есть свободные общинники, а не холопы) либо с личным именем или прозвищем Людиж — возможной краткой формой от древнерусского имени Людимир или Людислав. В украинской ономастике фиксируется прозвище Людиж, которое могло закрепиться за основателем рода.

Фамилия Людижинские — характерный памятник украинской и шире — славянской культуры. Формант -ин-ский встречается реже, чем просто -ский: он может указывать на принадлежность к роду владельца поместья (чьи? — Людижинские, то есть «принадлежащие Людижу») или на происхождение от населённого пункта с суффиксом принадлежности (Людижин — как вариант названия). Похожие по структуре фамилии — Гребенские, Бережинские, Хмелинские.

Точное место происхождения фамилии не установлено, но в исторических документах упоминаются поселения со сходными корнями на территории современной Украины и юга России. Например, село Людиж (Людеж) в Черниговской губернии. Окончательный вывод о времени возникновения фамилии Людижинские возможен только после углублённых генеалогических изысканий в конкретных архивах.