Фамилия Мачучина — редкий пример, где суффикс спорит с основой. На первый взгляд, перед нами типичная «материнская» фамилия: окончание -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Мачучин, а женская форма Мачучина закрепилась как фамилия в документах. Но в русской ономастике фамилии на -ин чаще образуются от основ на -а/-я (сын Кузьмы — Кузьмин), а здесь основа твёрдая: Мачуч(а) — и это заставляет присмотреться к слову пристальнее.

Самая вероятная версия ведёт к прозвищу Мачук или Мачука. В южнорусских и украинских говорах «мачук» — это не только молот или кувалда, но и прозвище крепкого, коренастого человека, которого в работе не остановить. Слово того же корня, что «махать» или «мачта» (нечто длинное и тяжёлое), но в бытовой речи закрепилось за инструментом. От Мачука через притяжательную форму Мачучин (сын Мачука) и родилась фамилия. Женское окончание -а в современном варианте — результат склонения или поздней паспортной записи.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с глаголом «мачучить» (мучить, маять) в некоторых западных диалектах. Тогда прозвище Мачуча мог получить человек въедливый или дотошный, «мающий» других. Однако эта гипотеза слабее: глагол редкий, а фамилия Мачучина встречается в основном в центральных и южных областях России, где «мачук» как орудие и прозвище куда привычнее.

География фамилии неширокая: чаще всего Мачучины живут в Воронежской, Ростовской областях и на Кубани. Это косвенно подтверждает связь с южнорусским говором. Среди дворянства фамилия не встречается — это крестьянская или казачья фамилия, где прозвище давалось по внешней черте или занятию. В архивах XIX века Мачучины числятся государственными крестьянами и однодворцами.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Мачуков, Мачукин, Мачуцкий — все они восходят к той же основе «мачук», но различаются суффиксами. Мачучина стоит особняком: если бы исходным было имя Мачук, логичнее ждать Мачуков. Форма на -ин возможна, если прозвище звучало как Мачуча (с окончанием -а), что для южных говоров нормально: там имена вроде Гаврила, Данила склоняются по женскому типу. Так что Мачучина — это, скорее всего, «вдова Мачуки» или «дочь Мачуки», где прозвище отца закрепилось в родительном падеже.

Спорных моментов в этимологии немного, и главный из них — ударение. В большинстве современных носителей фамилия звучит с ударением на второй слог: Мачу́чина. Но если исходное прозвище — Мачу́ка, ударение логично падает на «у». Если же в основе лежал глагол «мачучить», ударение могло сместиться на первый слог: Ма́чучина. Второй вариант встречается реже, но фиксируется в некоторых переписях начала XX века.