Фамилия Мачурина — женская форма, а в основе лежит мужская Мачурин. Её ядро — прозвище или нецерковное имя Мачура. Строение фамилии простое: корень «мачур-» и типичный русский суффикс принадлежности «-ин», который указывает на родство: «чей?» — Мачурин, то есть сын или потомок Мачуры.

Самая вероятная версия ведёт к диалектному слову «мачура» или «мачурый». В северных и сибирских говорах так называли человека угрюмого, нелюдимого, хмурого. В словаре Даля «мачура» — «угрюмый человек, молчун». Прозвища по характеру давали часто, и они легко закреплялись за родом. Менее распространённая, но возможная гипотеза связывает основу с глаголом «мачурить» — то есть мешкать, медлить, возиться. Так могли прозвать неторопливого человека.

Иной поворот — географический. В некоторых регионах «мачурой» называли вид рыбы или даже растение (например, мачурка — сорт табака). Но эти значения локальны и встречаются реже, чем прозвищное «угрюмец». Скорее всего, предок носителя фамилии получил своё прозвание за мрачный нрав или неспешность.

По модели образования фамилия Мачурин — типичная для центральной России и Поволжья, где суффикс «-ин» преобладает над «-ов» у основ на -а, -я. Встречается она негусто, без ярко выраженного ареала, что говорит о её прозвищном, а не топонимическом происхождении (нет села Мачурино, которое бы «размножило» фамилию).

В целом, фамилия Мачурина — это история про прозвище, данное за характер, и про обычный для русской ономастики способ закрепить его за потомками через суффикс «-ин». Никаких дворянских корней или редких экзотических версий за ней не тянется, что делает её честным отражением крестьянской или мещанской среды, где фамилии часто рождались из бытовых наблюдений.