Фамилия Магажанова — редкий случай, когда географический ключ оказывается важнее морфологического. Суффикс -ов указывает на русскую модель образования, но сама основа фамилии — тюркская. Скорее всего, перед нами патроним (фамилия по отцу) с арабско-тюркским именем в основе. Имя Магажан — это составное: первая часть «Мага» восходит к арабскому «Мухаммад» (в тюркской огласовке часто звучит как Мага, Махмет), вторая — «жан» (душа, человек, дорогой). Получается «душа Мухаммада» или «дорогой, как Мухаммад». Такие двусоставные имена с компонентом -жан очень характерны для казахской и татарской антропонимии.

Женская форма Магажанова говорит о том, что носительница — потомок человека по имени Магажан. Мужской вариант фамилии — Магажанов. Фамилия эта довольно редкая и имеет чёткую региональную привязку: основная масса носителей сосредоточена в Казахстане (особенно в северных и центральных областях) и среди казахской диаспоры в России. Встречается она и у татар, но реже.

С точки зрения словообразования здесь всё прозрачно: к тюркскому имени Магажан прирастили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде -ова). Это типичная модель для фамилий народов, вошедших в состав Российской империи: своё имя, а фамилию оформляли по русскому образцу. В отличие от, скажем, фамилии Магажановых, где основа могла бы быть топонимической (от названия села), здесь основа — личное имя, что подтверждается и структурой, и географией.

Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к конкретному сословию нет — это крестьянская или разночинская фамилия, возникшая не ранее середины XIX века, когда у казахов и татар начали массово закрепляться фамилии. Спорных версий тут немного: попытки возвести «Мага» к монгольскому «бага» (маленький) выглядят натяжкой, так как вторая часть «жан» — однозначно персидско-тюркская. Самая правдоподобная версия — арабское имя в тюркской обработке.