Фамилия Магдичанская — редкий случай, когда географическая основа почти наверняка перевешивает личное имя. Это типичная «географическая» фамилия, образованная по модели прилагательного с суффиксом -ск- и окончанием -ая, указывающим на женскую форму. В мужском варианте она звучала бы как Магдичанский. Такие фамилии обычно давались по названию места, откуда был родом человек: села, деревни, местечка. Вопрос в том, что это за место.

Корень «Магдич» — скорее всего, топоним. Можно предположить, что в основе лежит название населённого пункта вроде Магдичи или Магдич. Следов такого села на картах современной России или Украины почти нет, но это не должно удивлять: многие мелкие хутора и деревни исчезли в XX веке. Более вероятна связь с западными или юго-западными землями бывшей Речи Посполитой — территорией современной Беларуси, Украины или Польши. Суффикс -ич в названии (Магдичи) характерен именно для белорусской и польской топонимии (ср. Барановичи, Костюковичи). Сама основа «Магд-» может восходить к личному имени Магда (краткая форма от Магдалена) или к фамилии Магдич, которая, в свою очередь, произошла от того же имени. То есть первопредок мог быть известен как «Магдич» (сын или человек Магды), а его потомки, переселившись в другое место, получили прозвание «из Магдичей» — Магдичанские.

Суффикс -ан- в середине слова (Магдич-ан-ская) указывает на принадлежность к группе или выходцам откуда-то. В польской и западнорусской традиции такой формант часто добавляли к названиям мест на -ичи: например, из Барановичей — Барановичский, из Магдичей — Магдичанский. Это делает версию о происхождении от названия деревни Магдичи наиболее правдоподобной.

Фамилия явно не крестьянская по модели образования (суффикс -ский был типичен для шляхты и дворянства в Польше и на западе Российской империи), но со временем такие фамилии распространились и среди других сословий. Носительница фамилии Магдичанская, скорее всего, имеет предков из мелкой шляхты или зажиточных крестьян западных губерний, которые взяли фамилию по названию своего родового гнезда — деревни или усадьбы, которая сегодня может быть известна только по старым метрическим книгам или картам XIX века.