Фамилия Магельницкая — женская форма, мужской вариант — Магельницкий. Это типичная фамилия польского или западнорусского происхождения, образованная по модели с суффиксом -цк(ий). Такие фамилии чаще всего указывали на принадлежность к географическому объекту: селу, местечку или усадьбе.

В основе, скорее всего, лежит название населённого пункта вроде Магельница или Магельники. Подобные топонимы встречаются в Польше и на западе современной Беларуси. Корень «магель» неочевиден и редок. Можно предположить, что он восходит к диалектному польскому слову «magiel» — так называли ручную скалку для глажения белья или саму гладильную машину. В переносном смысле «magiel» могло означать «перетирка», «толчея» или даже прозвище болтливого человека, который «перетирает» новости. Соответственно, Магельницкий — выходец из местности, где был распространён этот промысел, либо человек, чьё прозвище дало имя целому селу.

Модель на -цкий в Речи Посполитой была типична для шляхты, однако со временем такие фамилии получили и крестьяне, и мещане, особенно после разделов Польши, когда фамилии стали фиксировать массово. Поэтому Магельницкие могли быть как мелкопоместными дворянами, владевшими хутором Магельница, так и простыми переселенцами, записанными по месту прежнего жительства.

Интересная деталь: в отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, Магельницкая сохраняет польский акцент на предпоследнем слоге (Магельни́цкая). В русской среде ударение могли смещать на «а», но исходная форма — именно с польской интонацией. Фамилия редкая, и её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких локальных гнёзд на территории бывшей Гродненской или Виленской губерний.