Фамилия Махлонов образована от прозвища Махлон. Оно ведет свое начало от нарицательного «махлан», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет следующим образом: «ушастая шапка». Вероятно, прозвище Махлон относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься пошивом или продажей головных уборов. Согласно другой гипотезе, фамилия Махлонов происходит от мужского имени Махлон, которое в переводе с древнееврейского означает «болезненный». Так и прозвище Махлон закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Махлонов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Махлон, со временем получил фамилию Махлонов.