Фамилия Махмутова восходит к мусульманскому мужскому имени Махмут. Оно является одним из вариантов имени Мухаммед, которое в переводе с арабского означает «прославляемый». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Махмутовых можно лишь на основании генеалогических исследований.