Фамилия Махоро — редкий случай в русской ономастике, где исходное слово почти наверняка не славянское, а заимствованное. В ней нет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу указывает на её позднее происхождение или на то, что она не прошла стандартную русификацию. По сути, это застывшее прозвище или, что вероятнее, украинская или белорусская фамилия, образованная от нарицательного слова без дополнительных формантов.

Корень «махор» напрямую связан с «махорка» — сортом крепкого табака. В XIX веке махорка была распространена в южных и центральных губерниях России, на Украине и в Белоруссии. Прозвище Махоро мог получить либо торговец этим табаком, либо человек, который постоянно его курил или нюхал, либо крестьянин, выращивавший махорку на продажу. Такие «табачные» прозвища нередки: вспомните фамилии Табаков, Тютюн (от украинского «тютюн» — табак). В пользу этой версии говорит и то, что слово «махорка» — просторечное, народное, а значит, прозвище могло быть ироничным или уличным.

Есть и вторая, менее очевидная версия — от глагола «махать» или существительного «махор» в значении «кисть, бахрома, махры». В южнорусских говорах «махор» могли называть лохмотья, обрывки одежды или что-то мохнатое. Тогда прозвище могло относиться к неопрятному, лохматому человеку или, наоборот, к тому, кто носил одежду с бахромой (что для крестьянского быта маловероятно). Эта версия слабее: от «махать» обычно образовывались фамилии через суффиксы (Махов, Махаев), а бессуффиксная модель для русского языка нетипична.

Географически фамилия Махоро встречается в основном на Украине и в южных областях России. В украинском языке слово «махорка» звучит как «махорка», и фамилия могла закрепиться в форме Махоро без окончания -а из-за особенностей местного произношения или при записи в документы. Сословно носители, скорее всего, были из крестьян или мещан — махорка была товаром простонародным, а не дворянским.

Таким образом, фамилия Махоро — это прозвище, данное по роду занятий или привычке, связанной с табаком. Она обошлась без суффиксов, что делает её похожей на украинские фамилии вроде Голота или Нетудихата. Если искать однокоренные, то ближе всего будут Махоркин или Махортов — но они образованы уже по русской модели, с суффиксами, а Махоро осталась в исходном виде.