Фамилия Махорина образована от прозвища Махора, и в её основе лежит глагол «махорить», то есть «курить табак». Скорее всего, так в старину называли человека, который был особенно пристрастен к курению, эта привычка бросалась в глаза и закреплялась за ним как постоянное прозвище. Прозвища, данные по привычкам и поведению, были очень распространены на Руси, и эта версия выглядит наиболее естественной.

Существует и вторая версия, которая относит прозвище Махора к «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий предка. В этом случае прозвище мог получить не тот, кто курил, а тот, кто выращивал или продавал крепкий табак — махорку. Такое занятие было довольно прибыльным, поэтому прозвище Махора могло закрепиться за торговцем или огородником.

Обе версии сходятся на одном корне, связанном с табаком, и вторая не противоречит первой: и курильщик, и продавец табака одинаково получали прозвище от одного слова. Правдоподобнее выглядит первая версия, поскольку прозвища по личным качествам и привычкам давались чаще, чем по роду занятий, который не всегда был очевиден для окружающих.

Модель образования фамилии проста и типична для русских фамилий. К основе Махор- добавился суффикс -ин, который указывает на принадлежность: Махорина — это «дочь или жена Махоры». В мужском варианте фамилия звучит как Махорин. Суффикс -ин в русских фамилиях использовался так же часто, как и -ов, и закреплялся за основами, оканчивающимися на гласный или мягкий согласный.

Интересно, что фамилия Махорин (и её женская форма Махорина) встречается в разных регионах России, но особенно часто — в центральных областях и в Поволжье, где махорка была широко распространена в крестьянском быту. Это косвенно подтверждает, что прозвище было связано именно с табаком, а не с каким-либо другим значением слова.

В некоторых говорах слово «махор» могло иметь и иное значение, например, обозначать небрежного или растрёпанного человека, но эта версия менее убедительна. Связь с табаком и глаголом «махорить» остаётся основной, и именно её следует считать исходной для фамилии Махорина.