Фамилия Макокина хранит в основе редкое слово, которое сразу выводит нас за пределы привычных «профессиональных» или «отчественных» моделей. Это не Иванов и не Кузнецов. Её ядро — «макок», вариант слова «макогóн» или «макогин». Так в южнорусских и украинских говорах называли приспособление для растирания мака, льна или табака — тяжёлый деревянный пест, которым толкли в ступе. Человек, работавший с такой ступой или изготавливавший их, мог получить прозвище Макокон или Макокин.

Суффикс -ин в фамилии Макокина указывает на патронимическое происхождение: «чей сын?» — Макокин, то есть сын Макоки (или Макокина). Женская форма Макокина — естественное родовое окончание, так как фамилия закрепилась в говорах, где суффикс -ин типичен для притяжательных фамилий от основ на -а, -я. Мужской вариант, соответственно, Макокин.

Географически фамилия тяготеет к югу России, особенно к Курской, Воронежской областям, а также к Украине, где слово «макогін» живёт до сих пор. В центральных и северных регионах России она встречается редко — это маркёр местного диалекта. В XIX веке Макокины могли быть крестьянами или мещанами, связанными с маслобойным или табачным промыслом, а также с домашним хозяйством, где ступа была обычным предметом.

Есть и другая, менее очевидная версия: в некоторых говорах «макок» означало не только пест, но и человека с крупной головой или несуразной фигурой — по аналогии с тяжёлым, неуклюжим предметом. Однако она уступает первой по правдоподобию, так как прозвища по орудиям труда в русской ономастике встречаются куда чаще, чем по внешности. Фамилия Макокина — редкий случай, когда бытовая утварь стала основой родового имени, обойдясь без иностранных корней и дворянских приставок.