Фамилия Макаокин — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее разбора корня. В этом написании она почти наверняка связана с Северо-Западом России, а точнее — с Псковской областью. Там, в псковских говорах, слово «макаока» или «макоха» означало нечто неопрятное, неряшливое, а иногда и просто «грязнулю». Прозвище Макаока или Макаох мог получить человек нечистоплотный, но не обязательно с отрицательным оттенком: в деревнях такие прозвища часто давали без злобы, по внешнему признаку.

Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «макать» — то есть окунать, обмакивать. В этом случае фамилия могла принадлежать человеку, связанному с каким-либо ремеслом: например, красильщику, который макал ткани в чан, или даже рыбаку, макающему сети. Однако форма «Макаокин» с ударным «о» и характерным чередованием (макать — макаок) встречается в основном именно в псковско-новгородском диалектном ареале, что делает версию с прозвищем-неряхой основной.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Макаокин — сын Макаоки. Это типичная модель русских фамилий от прозвищ на «-а». Встречаются и однокоренные варианты: Макаохин, Макаков, Макаев, но написание «Макаокин» самое редкое. Носители этой фамилии, скорее всего, ведут свой род из крестьянской среды Псковщины или соседних уездов Тверской губернии, где в XIX веке фиксируются единичные случаи записи этой фамилии в исповедных ведомостях. Более точных данных о древности фамилии нет, но по модели образования она не старше XVII века.