Фамилия Маколкина — женская форма фамилии Маколкин, и её разбор стоит начать с неочевидного: это не просто вариант фамилии Макалкин с заменой гласной. Перед нами случай, где корень может отсылать к двум разным источникам, и оба имеют право на существование.

Первый и наиболее вероятный путь — от прозвища или нецерковного имени Маколка. В русских говорах слово «маколка» (или «макулка») означало макушку, верхушку, а также небольшой пучок, кисточку или головку чеснока, лука. Прозвище Маколка могли дать человеку с заметной, торчащей макушкой, либо тому, кто постоянно ходил в шапке с кисточкой. По этой модели образована фамилия Маколкин: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Маколки). Такая схема типична для русских фамилий, произошедших от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я.

Вторая версия — тюркская основа. В татарском и башкирском языках «мак» — мак, а «олка» может быть искажением от «улка» (сын). Однако эта гипотеза слабее: в русских фамилиях, образованных от тюркских корней, обычно сохраняется более прозрачная структура (например, Максютов, Макаев). Прямое сложение «мак» + «олка» для тюркской ономастики нетипично, поэтому версия с русским прозвищем предпочтительнее.

С географической точки зрения фамилия Маколкина не принадлежит к числу широко распространённых. Её очаги — центральные и южные регионы России, где диалектное слово «маколка» было в ходу. Встречается и вариант написания через «а» — Макалкин, но это уже отдельная фамилия, которую могли носить потомки Макалки (от имени Макар).

Таким образом, предки современной Маколкиной — скорее всего, жители средней полосы России, носившие прозвище по внешней примете (макушка, кисточка) или по роду занятий, связанному с луком и чесноком. Фамилия не дворянская, а крестьянская или мещанская, что подтверждается отсутствием в «Общем гербовнике» и редкими упоминаниями в дореволюционных адрес-календарях.