Фамилия Маковкины — один из тех редких случаев, когда морфология сразу подсказывает, откуда пошла фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность конкретному лицу: Маковкин буквально значит «чей?» — сын, потомок или человек Маковки. Основа здесь не имя, а прозвище Маковка.

Слово «маковка» многозначно, и это даёт сразу две версии происхождения. Первая лежит на поверхности: мак выращивали и продавали, и прозвище Маковка мог получить крестьянин, который этим промышлял — сеял мак на продажу или торговал маковыми головками. В «Толковом словаре живого великорусского языка» Владимира Даля «маковка» прямо определяется как «маковая головка». Вторая версия связана со значением «верхушка, вершина». Маковкой в народе называли и макушку головы, и купол церкви, и вообще самую высокую точку. Поэтому прозвище могли дать либо высокому человеку, либо тому, чей дом стоял на возвышенности, на виду у всей деревни.

Интересно, что в ономастических записях Степана Веселовского встречаются оба варианта: Маковица и Маковка. Это были крестьяне XV–XVI веков из Новгородских земель. Значит, фамилия Маковкины уходит корнями в северо-западные области Руси, где прозвище Маковка было в ходу задолго до того, как превратилось в фамилию.

Словообразовательная модель простая: прозвище Маковка → притяжательное прилагательное Маковкин (сын Маковки) → фамилия. Такая схема типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, которые не были крестильными именами. Суффикс -ин здесь работает как показатель родства, и это помогает отличить фамилию от, скажем, Маковецких или Маковских, где суффикс -ск- указывает на географическую привязку.

Другие однокоренные фамилии (Маков, Маковецкий) могли возникнуть независимо, но Маковкины стоят особняком: их основа — уменьшительно-ласкательная форма, что придаёт прозвищу бытовой, даже пренебрежительный или, наоборот, ласковый оттенок. Такие фамилии редко встречаются в дворянских родословных, зато часто — в крестьянской и мещанской среде, где прозвища передавались по наследству без изменений.

Точное время и место возникновения фамилии Маковкины для каждой конкретной ветви можно установить только по архивным документам, но общая картина ясна: перед нами типичная русская фамилия от прозвища, связанного либо с ремеслом, либо с внешностью или местом жительства.