Фамилия Макуихина — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Скорее всего, она образована от прозвища или нецерковного имени Макуиха. В русской ономастике суффикс -их(а) характерен для северных и сибирских говоров: так называли женщину по её мужу (например, Иваниха — жена Ивана) или давали прозвище по характерному признаку. Макуиха могла быть женой человека по прозвищу Макуй или Макуха, но возможна и другая версия.

Основа «маку-» может отсылать к диалектному слову «макуха» — так в некоторых областях называют жмых, выжимки семян подсолнечника или конопли. В переносном смысле «макухой» могли прозвать человека невысокого роста, плотного телосложения или того, кто занимался производством масла. Фамилия Макуихина, таким образом, — это «вдова или дочь Макухи» (по модели «Иваниха — Иванихин»). Женский суффикс -ин в окончании указывает на принадлежность: «чьих будешь? — Макуихиных».

Встречаемость фамилии крайне низкая, и её география, по всей видимости, привязана к Русскому Северу или Поволжью — регионам, где активно бытовали прозвища на -иха и где переработка масличных культур была традиционным промыслом. Сословно это, скорее всего, крестьянская или мещанская фамилия: дворянские роды с таким окончанием почти не фиксируются.

Есть и менее вероятная, но лингвистически возможная гипотеза: связь с тюркским корнем «маку» (например, в значении «крепость», «убежище»), но в сочетании с русским суффиксом -их- она выглядит натянутой. Русская словообразовательная модель здесь первична. Фамилия Макуихина — живой пример того, как неброское прозвище, данное по бытовой детали или занятию, закрепилось в роду и дошло до наших дней.