Фамилия Макусинский — редкий пример, где географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную. Она образована по польско-белорусской модели с суффиксом -ский, который в восточнославянских фамилиях чаще всего указывает на дворянское происхождение или владение землёй: «человек из такого-то места». Поэтому первое, на что смотришь, — топоним.

Основа «Макусин» или «Макушино» встречается в нескольких регионах. Есть деревня Макушино в бывшей Витебской губернии, есть село Макусино на Черниговщине, а также ряд мелких хуторов с похожими названиями в Польше (Макуси, Макусы). Человек, переселившийся из такого места, получал прозвище «Макусинский» — то есть «выходец из Макусина». Это классический путь возникновения фамилий этой группы: не от имени, а от названия родового гнезда.

Менее вероятная, но не исключённая версия — от прозвища «Макуса» или «Макус». В диалектах это могло означать либо уменьшительное от «мак» (ср. «макушка», «маковка»), либо человека с круглой головой, либо торговца маком. Однако суффикс -ский при такой основе был бы нетипичен для крестьянского прозвища — он слишком «шляхетский». Скорее всего, если бы прозвище было, фамилия звучала бы как Макусин или Макусов. Именно выбор модели на -ский и заставляет отдать предпочтение географическому объяснению.

В польской ономастике фамилия Маkusiński фиксируется с XVI–XVII веков, и чаще всего её носители — мелкая шляхта, владевшая одноимёнными фольварками. В русских губерниях фамилия встречается редко и почти всегда в западных областях — Смоленской, Могилёвской, Черниговской, что подтверждает её польско-белорусские корни. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Маку́синский, хотя в разговорной речи нередко смещается на третий — Макуси́нский, под влиянием более привычных фамилий на -инский.

Таким образом, предки носителя фамилии Макусинский — скорее всего, мелкопоместные дворяне или шляхтичи, чья фамилия родилась не из личного качества, а из названия места, где стояла их усадьба. Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего Макушин, Макушев и Макусин — они образованы по другой модели и, как правило, от прозвищ, а не от топонимов.