Основой фамилии Макушинский послужило церковное имя Макуша. Фамилия Макушинский образована от имени Макуша. Макуша, по одной из версий, является просторечной формой христианских мужских имен Мокей (в переводе с греческого – «насмешник»), Максим (в переводе с латинского – «величайший»), Макар (в переводе с греческого – «блаженный, счастливый»). Скорее всего, основатель рода Макушинских был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Согласно другой гипотезе, Макуша употреблялось в качестве прозвища, образованного от нарицательного «макушка» - «вершина, верхушка». Поэтому Макушей могли называть рослого человека. Тем не менее, первая версия выглядит более правдоподобно. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Макуша, со временем получил фамилию Макушинский.