Основой фамилии Макушева послужило церковное имя Мокей. Фамилия Макушева образована от имени Макуш, просторечной формы христианских мужских имен Мокей (в переводе с греческого – «насмешник»), Максим (в переводе с латинского – «величайший»), Макар (в переводе с греческого – «блаженный, счастливый»). Скорее всего, основатель рода Макушевых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Менее вероятно, что фамилия Макушева происходит от прозвища Макуш, которое восходит к нарицательному «макушка». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Макуш, со временем получил фамилию Макушева.