Основой фамилии Макушова послужило имя Макуш. Фамилия Макушова образована от имени Макуш, производной формы христианских мужских имен Мокей (в переводе с греческого – «насмешник»), Максим (в переводе с латинского – «величайший»), Макар (в переводе с греческого – «блаженный, счастливый»). Скорее всего, основатель рода Макушовых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Менее вероятно, что фамилия Макушова ведет свое начало от прозвища Макуш, которое восходит к нарицательному «макушка». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Макуш, со временем получил фамилию Макушова.