Фамилия Макушенко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от имени Макуша. По одной из версий, Макуша является просторечной формой христианских мужских имен Мокей (в переводе с греческого – «насмешник»), Максим (в переводе с латинского – «величайший»), Макар (в переводе с греческого – «блаженный, счастливый»). Согласно другой гипотезе, Макуша употреблялось в качестве прозвища, образованного от нарицательного «макушка» - «вершина, верхушка». Поэтому Макушей могли называть рослого человека. Тем не менее, первая версия выглядит более правдоподобно. Это прозвище могло быть образовано и от украинского слова «макуха» - «остатки после отжима масла из семян масличных культур; выжимки», а в переносном смысле - «вялый человек». Поэтому Макушенко буквально понималось как «сын Макуши».