Фамилия Малабекова — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все другие версии. Это осетинская или ингушская фамилия, и её основа — мужское имя Малабек. Такие имена характерны для народов Северного Кавказа, где «Мала» (от арабского «малик» — «царь», «владыка») соединяли с тюркским «бек» (князь, господин). Получается имя со значением «владыка-князь» или «царственный господин» — типичный для региона композит, подчёркивающий знатность или пожелание высокого положения.

В русской записи фамилия получила суффикс -ов, который в данном случае выполняет чисто грамматическую роль: он русифицирует окончание, делая фамилию склоняемой. Без него форма Малабек осталась бы неизменяемой для женщины, а суффикс -а в женском варианте (Малабекова) — это стандартное русское окончание, указывающее на принадлежность к роду. То есть носительница фамилии — женщина из рода Малабековых.

Корень «Малабек» сам по себе двусоставный, и это важно: он не даёт фамилии распадаться на прозвище и профессию. Здесь нет ни ремесла, ни внешности предка — только имя, которое ему дали при рождении. Такие фамилии (так называемые патронимические) на Кавказе нередко закреплялись за целым родом или фамилией, а не за одним человеком. Если искать аналоги, то это как фамилии Магомедов, Ахмедов или Беков — тоже от личных имён.

В сословном плане носители фамилии могли быть из разных слоёв: имя Малабек давали и в среде горской аристократии, и в крестьянских семьях. В советское время фамилия стала единой для всех потомков, и сейчас её можно встретить не только в Ингушетии и Северной Осетии, но и в других регионах России, куда люди переезжали. Единственное, что стоит помнить: ударение, скорее всего, падает на последний слог — Малабе́кова, как это принято в осетинском и ингушском произношении.