Фамилия Махабекова — женская форма фамилии Махабеков, и её происхождение почти наверняка ведёт на Кавказ, а точнее — в осетинскую или ингушскую языковую среду. В основе лежит личное имя Махабек, которое состоит из двух частей. Первая часть «Мах» восходит к арабскому «мухаммад» (прославленный, достохвальный) — имени пророка, широко распространённого в мусульманских культурах. Вторая часть «бек» — тюркский титул, означающий «господин», «князь», «правитель». Таким образом, имя Махабек можно перевести как «господин Мухаммад» или «князь Мухаммад», что типично для сложносоставных имён, популярных у народов Северного Кавказа в XIX — начале XX века.

Фамилию образовали по русской модели с суффиксом -ов/-ев, который добавляли к местным именам и прозвищам при оформлении официальных документов. Махабеков — «сын Махабека» или «принадлежащий роду Махабека». Женская форма Махабекова — это грамматическое согласование: дочь или жена Махабекова. Такая модель словообразования — массовая для фамилий кавказских народов, попавших под административный учёт Российской империи во второй половине XIX века. Фамилия не древняя, а «кабинетная»: её зафиксировали при переписях и записях в метрических книгах, и она закрепилась за целым родом.

Носители фамилии Махабековы встречаются преимущественно в Северной Осетии, Ингушетии и среди осетинской диаспоры. Встречается также вариант написания Махабеков, а иногда — с ударением на последний слог. Спорных версий происхождения здесь почти нет: арабско-тюркский состав имени очевиден, а русский суффикс — стандартная канцелярская добавка. Редкость фамилии указывает на то, что родоначальник был, скорее всего, конкретным человеком с именем Махабек, а не целой группой одноимённых людей. Искать какую-то доисламскую или чисто тюркскую этимологию для «Мах» в данном случае излишне — контекст кавказского имясловия подсказывает именно арабское заимствование.