Фамилия Мальчушкина — женская форма фамилии Мальчушкин. Разговор о ней стоит начать с суффикса -ин, который в русской антропонимии указывает на принадлежность: Мальчушкин значит «сын Мальчушки» или «человек из семьи Мальчушки». Такая модель характерна для северных и центральных областей России, где -ин был основным патронимическим суффиксом, в отличие от южных регионов с их -ов/-ев.

В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Мальчушка. Это уменьшительно-ласкательная форма от слова «мальчик» или «малый». В древнерусской традиции прозвища, данные по возрасту или внешности, были обычным делом: Малой, Малыш, Мальчуган. Мальчушка — не просто «маленький», а скорее «младший», «парнишка», «подросток». Такое имя могли дать младшему сыну в семье, чтобы отличать его от старших братьев, или же рослому мужчине с детским лицом — в насмешку.

Интересная деталь: суффикс -ушк- в прозвище Мальчушка не столько уменьшительный, сколько ласкательно-пренебрежительный. В говорах XVII–XVIII веков слова с -ушк- нередко обозначали человека несерьёзного, молодого, неопытного. То есть предок носительницы фамилии мог получить прозвище не столько за рост, сколько за поведение — например, за юношескую удаль или незрелость поступков.

Фамилия Мальчушкина не относится к числу дворянских или купеческих: её носители, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Встречается она преимущественно в центральной России и Поволжье — там, где была распространена модель на -ин. В дореволюционных переписях Мальчушкины фиксировались, например, в Тверской и Костромской губерниях. Поскольку фамилия редкая, её географическая привязка довольно узкая, и современные носители часто могут проследить родословную до одной-двух деревень.