Фамилия Маличкина — женская форма, а её носительниц объединяет общее мужское имя предка: Маличка. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Маличка, которое, скорее всего, образовано от слова «малый» — то есть «маленький, младший». В русской традиции такие имена часто давали младшему сыну в семье или невысокому человеку. Суффикс -к- в данном случае имеет уменьшительно-ласкательное значение, так что Маличка — это буквально «малыш», «маленький».

Словообразовательная модель проста: к основе Малич- добавляется патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Маличкин). Фамилия фиксирует отчество: сын Малички, то есть потомок человека по прозвищу Маличка. Обратите внимание на суффикс -ич- в основе: он типичен для кратких форм русских имен (ср. Иванович, Петрович), но здесь он врос в прозвище, что встречается реже, чем стандартные -ов/-ев.

Географически фамилия Маличкины тяготеет к центральным и северным регионам России. Встречается в архивных записях по Вологодской, Костромской и Ярославской губерниям — это зона бытования фамилий на -ин, где прозвища на -ка особенно распространены. В дореволюционных переписях Маличкины чаще всего числились крестьянами или мещанами, реже — купцами.

Стоит упомянуть и альтернативную версию. В некоторых говорах «маличка» могло означать не человека, а предмет — например, уменьшительное от «малик» (след, тропа) или диалектное название мелкой рыбешки. Но эта версия менее вероятна: прозвищные фамилии от названий животных или предметов обычно сохраняют прямой смысл (Сомов, Котов), а здесь явно просвечивает антропонимический корень «мал-». Спорных гипотез больше нет — фамилия прозрачна и не требует сложной расшифровки.

Таким образом, Маличкины — потомки человека, которого в семье или в округе звали ласково «малышом». Фамилия не редкая, но и не массовая: её носители — это, как правило, потомки крестьянского населения Русского Севера, где уменьшительные прозвища часто становились официальными фамилиями.