Фамилия Малимоненко — редкий пример украинской фамилии, построенной по модели, где прозвище Малимон соединили с суффиксом «-енко». В XVI–XVIII веках суффикс «-енко» в Поднепровье означал не просто «сын такого-то», а «младший, потомок, принадлежащий к роду». Так что Малимоненко дословно — «сын Малимона» или «из рода Малимоновых».

Основа Малимон в украинской ономастике неоднозначна. Самая прямая версия — это народная форма крестильного имени Емельян (от греческого «аймилиос» — ласковый, приветливый). В украинских говорах Емельян легко превращался в Омелян, а далее в Малимон через сокращение и перестановку слогов. Такая трансформация — обычное дело в живой речи: имя теряло начальную гласную и обрастало местными суффиксами.

Есть и вторая, менее вероятная версия — связь с польским словом «malimon», которое в диалектах означало «крикливый человек» или «пустомеля». Но это скорее случайное созвучие: в польских источниках такое прозвище встречается редко, а для украинской традиции типичнее именно имя в основе.

Географически фамилия Малимоненко привязана к центральным и восточным областям Украины — Черкащине, Киевщине, Полтавщине. В метрических книгах XIX века она встречается преимущественно в сёлах, где жили казацкие и крестьянские роды. Сословная принадлежность носителей — в основном государственные крестьяне и казаки, то есть свободное население, которое не знало крепостного права. Поэтому за фамилией не стоит ни дворянская усадьба, ни панский двор — только сельская община и память о предке по имени Малимон.