Фамилия Малмакова — вариант женского рода, мужская форма — Малмаков. Сразу обращает на себя внимание необычный корень «малм-», который не встречается в русских нарицательных словах. Это почти наверняка указывает на тюркское происхождение основы. Фамилия редкая, сконцентрирована в нескольких регионах, что помогает сузить круг поиска.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Малмаков — потомок человека по прозвищу или имени Малмак. Основа «Малмак» могла быть личным именем или прозвищем у тюркских народов (татар, башкир, казахов, ногайцев). В тюркских языках «мал» — скот, имущество, богатство. Соответственно, «малмак» могло означать «скотовод», «владелец скота», «богатый скотом» — прозвище, данное по роду занятий или достатку. Вторая часть «-мак» — распространённый тюркский аффикс, образующий имена и прозвища (сравните: Калмак, Тормак).

Есть и другая версия: основа «Малмак» могла быть вариантом имени Малмухаммет или Малмагомед (где «мал» — «маленький», «младший» в некоторых тюркских диалектах). В таком случае фамилия образована от сокращённой формы сложного имени, что тоже характерно для татарской и башкирской ономастики.

География фамилии Малмакова в основном привязана к южному Уралу и Западной Сибири — Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Курганская области. Встречается и у алтайцев. Если ваши предки жили в этих местах, скорее всего, они были из башкир, татар или казахов, которые приняли православие и получили русскую фамилию по отцу. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии нередко фиксировались у крещёных татар и башкир-припущенников. Социальный статус — чаще крестьяне или казаки, реже купцы.

Таким образом, фамилия Малмакова почти наверняка несёт в себе память о тюркском предке, которого звали или прозвали Малмаком — скорее всего, зажиточным скотоводом или просто младшим сыном в роду.