Фамилия Малмыгина — женская форма фамилии Малмыгин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Малмыга. Разберём, что оно могло означать и где могло возникнуть.

Слово «малмыга» в русских говорах неоднозначно. В вятских и пермских диалектах так называли неповоротливого, медлительного человека, иногда — рохлю или разиню. В других областях «малмыга» могла означать «малорослый, низкорослый человек» (от общеславянского корня «мал-»). Есть и версия, что прозвище связано с названием города Малмыж в Кировской области. В таком случае Малмыга — это прозвище выходца из этих мест, а фамилия Малмыгин — типичное «географическое» образование по модели «откуда родом» (сравните: Москва — Москвин, Казань — Казанцев, Малмыж — Малмыгин). Город Малмыж стоит на реке Вятке, известен с XVI века, и его название, скорее всего, марийского происхождения (от марийского «малмыж» — «медвежий угол» или «заячий угол»).

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: буквально «чей?» — сын Малмыги, то есть потомок человека с таким прозвищем. В русских фамилиях суффикс «-ин» чаще присоединялся к основам на -а/-я, что здесь и видим.

Самая правдоподобная версия — прозвищная, от диалектного «малмыга» в значении «медлительный человек». Она объясняет и форму, и логику прозвища: в крестьянской среде такие бытовые характеристики давали часто. Географическая версия (от Малмыжа) тоже возможна, но менее вероятна: фамилии от названий городов обычно образуются с суффиксом «-ский» (Малмыжский) или «-цев» (Малмыжцев), а «Малмыгин» — это скорее от личного прозвища.

Фамилия редкая, встречается преимущественно на севере и северо-востоке европейской части России — в Кировской, Пермской областях, Удмуртии. Это подтверждает связь с вятским диалектом. Носительницы фамилии Малмыгина могут с большой долей уверенности считать, что их предки жили в тех краях и получили прозвище за неторопливый нрав или невысокий рост.