Фамилия Малогловец — один из тех редких случаев, когда прозвище почти не изменилось за несколько веков. Она образована напрямую от словосочетания «малый гловец». Вторая часть — «гловец» — диалектное или устаревшее слово. Скорее всего, это вариант слова «гловка» (головка) или производное от «голова». В таком случае «малый гловец» — это «маленькая головка», то есть прозвище человека с небольшой головой. Возможно, речь шла о младшем сыне в семье, которого называли «малоголовцем» по аналогии с «малоголовкой» — уменьшительно-пренебрежительной формой.

Версия с ремеслом менее вероятна. В некоторых говорах «гловец» могло означать «ловец» (от «гловить» — ловить), но приставка «мало-» в русских фамилиях редко указывает на низкую квалификацию ремесленника. Обычно «мало-» в прозвищах описывает внешность или возраст, а не умение.

Словообразовательная модель фамилии — нулевой суффикс, типичный для прозвищ, перешедших в фамилии без изменений. Окончание -ец указывает на принадлежность к лицу: «тот, кто малогловец». Фамилия не получила патронимического суффикса -ов/-ев, что характерно для украинских и белорусских фамилий, а также для части южнорусских. Встречается она преимущественно в западных регионах бывшей Российской империи — на территории современной Украины, Беларуси и в прилегающих областях России (Брянская, Смоленская).

В отличие от фамилий вроде Малоголов или Малоголовко, форма Малогловец сохранила архаичный суффикс -ец, который со временем почти исчез из русских фамилий, заменённый на -ов. Поэтому носитель фамилии Малогловец может с высокой вероятностью проследить свои корни в западнорусской или украинской среде XVI–XVII веков, где прозвища фиксировались в документах без дополнительных приращений.