Фамилия Малоханов — яркий пример того, как при разборе можно споткнуться на, казалось бы, очевидном корне. На первый взгляд, основа «малый» или «мало» прямо указывает на прозвище невысокого или незначительного человека. Однако есть важный нюанс: слово «малохан» в русских говорах, особенно на юге и в казачьих областях, имело совсем другое значение. Так называли человека малорослого и тщедушного, но при этом юркого и пронырливого. То есть прозвище Малохан могло быть не обидным, а скорее характеризующим подвижность и хитрость.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель — «сын Малохана». Фамилия явно происходит от прозвища, а не от крестильного имени, поскольку такого имени в святцах нет. Словообразовательная цепочка проста: прозвище Малохан (от «малый» с экспрессивным суффиксом -хан) плюс фамильный суффикс -ов.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где были распространены говоры с уменьшительно-уничижительными формами на -ан/-хан: это южнорусские области, Поволжье и бывшие казачьи земли. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища.

Стоит отметить и возможную тюркскую версию, хотя она менее вероятна. В некоторых тюркских языках «мал» означает «скот», а «хан» — титул. Тогда «малохан» могло быть ироничным прозвищем «скотий хан», то есть пастух или скотовод. Однако для славянской ономастики такое смешение корней нетипично, и версия с «малым» остается основной.

Социальный состав носителей, скорее всего, был крестьянским или казачьим. Фамилия не дворянская и не духовная — её не встретишь в родословных книгах или семинарских списках. Это прозвище, закрепившееся за родом в XVI–XVII веках, когда активно формировались русские фамилии у простого люда.