Фамилия Малокотин — редкий случай, где прозвище-основа спорит с суффиксальной моделью. Сразу бросается в глаза: в ней нет типичного для русских фамилий суффикса -ов/-ев или -ин. Окончание -ин есть, но оно присоединяется к основе на -от-, а не напрямую к корню. Это наводит на мысль, что перед нами не «сын Малокотия», а скорее прозвище, образованное через суффикс -от(а), как «дремота», «зевота» или «ломота». Соответственно, Малокотин — «тот, кто относится к человеку по прозвищу Малокота».

Что такое «Малокота»? Самый прямой разбор: «малая кота». Слово «кота» в русских говорах имеет несколько значений. В центральных и южных областях так называли кошку (ласкательно или просторечно). Но есть и другое, более редкое значение — «мелкая рыба, малёк» или даже «небольшая куча, копна» (от «котить» — скатывать, сгребать). Если прозвище дали человеку, то, скорее всего, по внешности или повадке: маленький, юркий, «как котёнок», или, наоборот, невысокий, но цепкий, «как кошка». Вряд ли здесь связь с рыбой — слишком специфично для прозвища.

Версия с суффиксом -от- не единственная. Можно предположить, что основа — «малокот» (от «малый кот»), а -ин — притяжательный суффикс. Тогда фамилия означала бы «сын Малокота» (то есть человека, которого прозвали «маленьким котом»). Разница в оттенке: Малокотин — буквально «чей? — Малокоты». Но для имени или прозвища форма «Малокот» звучит неестественно для русского уха, а «Малокота» — как раз характерна для прозвищ, оканчивающихся на -а.

Географически фамилия редкая, встречается точечно в центральных областях России. Сословно — почти наверняка крестьянская: прозвища с бытовой, «домашней» основой (животные, предметы) типичны для непривилегированных слоёв. Дворянские фамилии редко строятся на таких простых и конкретных образах. Так что предки носителя фамилии Малокотин, скорее всего, были крестьянами, а прозвище закрепилось за их родом из-за какого-то одного человека — невысокого, подвижного или, возможно, любившего кошек.