Фамилия Малоушкины — яркий пример того, как внешняя особенность человека становилась его прозвищем, а затем закреплялась за родом. В основе фамилии лежит прозвище Малоушко: так в старину называли человека с маленькими ушами. Модель образования проста и прозрачна: прозвище Малоушко + типичный русский суффикс принадлежности -ин, указывающий на то, что речь идет о «сыне Малоушки» или «потомке Малоушки». Суффикс -ин в этой фамилии — не редкий, а самый ходовой для основ, оканчивающихся на -а/-о.

Интересно, что прозвища по размеру ушей не были единичными. В русской традиции существовали и антонимичные прозвища — Большое Ухо, Ухан, а также образные «Ухо-парень» или «Ухорез», которые давали не за размер, а за лихость. Фамилия Малоушкин стоит в этом ряду особняком, поскольку фиксирует именно физическую примету, а не характер. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные прозвища отмечены как типичные для «внешнего» слоя антропонимии.

Точное место возникновения фамилии Малоушкин установить сложно: процесс закрепления прозвищ в качестве фамилий шёл неравномерно в разных регионах России. Однако можно предположить, что фамилия бытовала преимущественно в северных и центральных говорах, где суффикс -ин особенно активен. По социальному составу носители могли быть как крестьянами, так и посадскими людьми — прозвище не несло сословной окраски.

В написании фамилии возможна вариативность: форма Малоушкин (с суффиксом -ин) и более редкая Малоушков (с суффиксом -ов) — обе образованы от одного и того же прозвища, но по разным словообразовательным моделям. Первая встречается чаще, что подтверждает её органичность для русской фамильной системы.