Фамилия Мамадусайнов — одна из тех, что сразу указывает на географию и культурные корни. Её основа — имя Мамадусайн, которое представляет собой народную, бытовую форму арабского имени Мухаммад Хусейн. Такое сращение двух имён в одно — характерная черта для регионов Центральной Азии, особенно Узбекистана и Таджикистана, где длинные имена часто сокращали и сливали для удобства произношения. Суффикс -ов — классический русский патронимический суффикс, который в XIX–XX веках массово добавляли к фамилиям народов Средней Азии в процессе русификации документов. Таким образом, Мамадусайнов — это не просто фамилия, а буквально «сын Мамадусайна», где Мамадусайн — это «Мухаммад Хусейн» в местном произношении.

Имя Мухаммад Хусейн имеет глубокое религиозное значение: Мухаммад — имя пророка ислама, а Хусейн — внук пророка, почитаемый шиитами и суннитами. В Центральной Азии такие составные имена были особенно популярны среди оседлого населения, в среде ремесленников, торговцев и земледельцев. Носитель фамилии Мамадусайнов с высокой вероятностью происходит из семьи, где чтили исламские традиции, а предки могли быть уважаемыми людьми в махалле — квартальной общине.

Редкость фамилии — ещё одна её особенность. Она не встречается массово, в отличие от, скажем, Мамадалиевых или Мамаджановых. Это говорит о том, что родословная, скорее всего, восходит к конкретному человеку по имени Мамадусайн, а не к целому роду или профессии. В современной России и странах СНГ фамилия Мамадусайнов остаётся малочисленной и сосредоточена преимущественно в среде выходцев из Ферганской долины и соседних областей Узбекистана.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Мамадусаинов, Мамадусайнов, — то вариант с буквой «й» в середине более архаичен и точнее передаёт местное произношение, где звук [й] между гласными сохраняется. В документах советского времени могли писать по-разному, но именно форма Мамадусайнов закрепилась как основная.