Фамилия Мананинк — редкая и нестандартная для русского ономастикона. В ней нет привычных суффиксов -ов/-ев, -ин, -ский, которые указывают на принадлежность отцу или месту. Окончание -нк сразу выдает западнославянское или балтийское влияние: так часто оформляли фамилии в Беларуси, Польше и Литве. Суффикс -ан- в основе может быть как уменьшительным, так и образующим прозвище.

Самое вероятное объяснение — фамилия происходит от прозвища или имени Мананя. Это уменьшительная форма от православных имен Емельян (через вариант Маня) или Максим (через Мана). В белорусских и польских говорах «мана» означало «обман», «приманка» или «видение», так что прозвище Мананя могло достаться хитрому, изворотливому человеку или тому, кто любил рассказывать небылицы. В литовском языке žodis «manas» значит «мой», но это маловероятная основа для фамилии.

С точки зрения географии, фамилия Мананинк почти наверняка привязана к западным регионам бывшей Российской империи — современным Беларуси, Литве или восточной Польше. Именно там суффикс -ик/-ык (в данном случае -нк как вариант) широко использовали для образования фамилий от личных имен и прозвищ. В русской традиции такую фамилию могли «обрусить», добавив окончание -ов, но этого не произошло, что говорит о сохранении исходной региональной формы.

Сословная принадлежность предков-носителей фамилии, скорее всего, была крестьянской или мещанской. Фамилии на -ик в этой среде часто давали по отцу или по характерной черте человека, а не по профессии. Поскольку фамилия крайне редкая, ее носители могли принадлежать к одной локальной группе, возможно, к небольшому роду из одного села или местечка.