Фамилия Манако — одна из тех, что ставит перед исследователем выбор между двумя совершенно разными корнями: церковным и бытовым. И обе версии имеют под собой основание.

Согласно первой, наиболее распространённой гипотезе, фамилия относится к типу украинских фамилий, образованных от крестильного имени. Основой послужило имя Манак — разговорная, народная форма церковного имени Мануил, которое, в свою очередь, восходит к древнееврейскому Иммануил. В переводе с греческого это означает «с нами Бог». Святым покровителем считается мученик Мануил, пострадавший за веру в 304 году в Сирии вместе с Феодосием. Таким образом, предок-родоначальник Манако мог носить это имя, а суффикс -ко (характерный для украинской, а также белорусской и южнорусской ономастики) превратил его в фамилию, означающую «сын Манака» или просто «маленький Манак».

Вторая версия ведёт родословную не от святого, а от прозвища. Она связывает слово «манак» с идишем: «менакер» — это человек, который по правилам кашрута удаляет из мяса запрещённый жир и вены. В народе такое занятие могло осмысляться иронически, и прозвище Манак могли дать тому, кто «не способен устоять перед соблазнами», то есть пренебрегает строгими правилами, или же, наоборот, человеку, профессионально занимающемуся разделкой мяса. Эта версия объясняет бытование фамилии в среде еврейского населения и её возможную связь с ремеслом.

Интересно, что исторические документы фиксируют фамилию в разных социальных слоях. В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского упоминаются: Манак Григорий, крестьянин (1545 г., Новгород), Иван Злобин Манаков (1596 г., Смоленск) и Манаковы — помещики конца XVI века в Вотской пятине. Эти записи показывают, что фамилия (в форме Манаков) бытовала не только в украинских землях, но и на северо-западе Руси, причём как среди крестьян, так и среди служилых людей.

Что касается формы Манако, она закрепилась преимущественно на территории современной Украины. В этом случае суффикс -о указывает не на принадлежность (как -ов/-ев), а на происхождение или прозвищную основу. Учитывая, что обе версии (именная и прозвищная) имеют право на существование, точное значение фамилии для конкретной семьи можно определить только по генеалогическому исследованию и региону проживания предков.