Фамилия Манифасов — один из тех редких случаев, когда за русским суффиксом скрывается нерусская основа, причем не греческая и не латинская, как можно было бы подумать, а тюркская. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не связан с «манифестом» или «манифестацией». Основа восходит к мужскому личному имени Манифас, которое является формой арабского имени Маниф — «высокий», «возвышенный», «знатный». В мусульманской среде имя было распространено, а у русских оно прижилось как прозвище, данное либо выходцу с Востока, либо человеку, которого так прозвали за стать или гордый нрав.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе Манифас добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын Манифаса», «принадлежащий Манифасу». Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Мани́фасов, хотя в устной речи могли смещать его на последний слог, подравнивая под более привычные фамилии на -ов.

Географически фамилия редкая и, вероятно, привязана к регионам, где исторически смешивались русское и тюрко-татарское население — Поволжье, Приуралье, южные губернии. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она встречается единично, что говорит о её локальном бытовании: носители, скорее всего, происходили из одной или нескольких семей, а не из широкого сословия.

С точки зрения социального контекста, предок-носитель имени Манифас мог быть крещёным татарином или башкиром, либо русским, получившим прозвище в инородческой среде. Фамилия не дворянская — суффикс -ов в сочетании с личным именем характерен для крестьян и мещан. В современной России она остаётся штучной, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска: каждый носитель, скорее всего, состоит в родстве с остальными.