Фамилия Марисей — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. На первый взгляд кажется, что перед нами что-то связанное с именем Марис (латинское «морской»), но в русской традиции это не так. Скорее всего, фамилия имеет польские или белорусские корни.

Ключ к разгадке — суффикс -ей. В русском языке он нетипичен для фамилий (обычны -ов, -ин, -ский). Зато в польской и западнорусской (белорусской) ономастике суффикс -ej встречается в фамилиях, образованных от прозвищ или имён с помощью притяжательного значения: «чей?» — Марисеев, то есть «сын Марисея». Но само имя Марисей — это народная форма от канонического имени Маврикий (лат. Mauricius — «мавр», «тёмный», «житель Мавритании»). В польском языке это имя звучало как Marysej, Morysej, а в белорусском — Марысей. Фамилия закрепилась в форме, близкой к живому произношению: Марисей.

Есть и вторая, более прозаичная версия. В южнорусских и украинских говорах слово марисей (или марисейка) могло означать «малорослый человек», «коротышка». Это прозвище давали невысокому, щуплому человеку. В таком случае фамилия образована напрямую от прозвища без дополнительного суффикса — по модели «прозвище стало фамилией» (как Жук, Коваль, Толстой). Эта версия кажется даже более правдоподобной, потому что объясняет необычное окончание: фамилия просто «застыла» в форме именительного падежа, что характерно для украинских и белорусских фамилий (сравните: Дрозд, Шевченко, Марисей).

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Речи Посполитой — современные Польша, Беларусь, запад Украины. В России она встречается крайне редко, в основном как результат миграции. Сословная принадлежность носителей, скорее всего, была крестьянской или мещанской — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, фамилия Марисей — это либо память о предке по имени Маврикий (в местном произношении), либо прозвище, данное за невысокий рост. В любом случае, она хранит следы живого языка западных славянских земель, где фамилии часто не подгоняли под стандартные русские суффиксы.