Фамилия Марнопольський — редкий пример, где топонимическая основа сочетается с неочевидным первым элементом. Если отбросить суффикс -ськ-, указывающий на происхождение от географического названия (типичная модель для польской и украинской шляхты), остаётся корень Марнополь. Первая часть — Марно — настораживает: в польском и украинском языках слово «марно» значит «напрасно, зря, тщетно». Казалось бы, «Марнополь» можно перевести как «пустой город» или «напрасное поле», что звучит странно для названия поселения.

На самом деле, скорее всего, перед нами не прямой перевод, а искажение или народное переосмысление. В основе могло лежать имя Марно — краткая форма от Мартин, Маркел или Марьян (ср. польское Marno как вариант имени Marcin). Тогда Марнополь — это «город Марна», то есть поселение, названное по имени владельца или основателя. Такая модель (личное имя + -поль) широко распространена: Станиславов, Ивангород, Марьинополь. Фамилия Марнопольський, соответственно, закрепилась за выходцем из такого места.

Вторая версия — связь с польским словом marny («бедный, скудный, ничтожный»). Если земля в этих краях была неплодородной, поселение могли в шутку или с досадой назвать Марнополь — «убогий город». Фамилия тогда носила бы прозвищный оттенок, но для этого нужно, чтобы топоним действительно возник из бытовой характеристики, что реже.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским и польским землям (Волынь, Подолье, Галичина). В современных польских и украинских справочниках она встречается единично, что подтверждает её локальный характер. Носители могли быть мещанами или мелкой шляхтой, получившей фамилию по имению, а не по родовому гербу. Суффикс -ський в украинском варианте (в польском было бы Marnopolski) указывает на принадлежность к определённой местности, но не обязательно на дворянство — в XIX веке такие фамилии нередко давали крестьянам при переписях, если они жили в деревне с похожим названием.

Однокоренные аналоги — Марнопольцев, Марнопольский (с русским окончанием) — встречаются ещё реже. В целом, фамилия Марнопольський хранит память о небольшом, возможно, уже не существующем поселении, чьё название со временем стало звучать как «напрасный город», хотя изначально, вероятно, было личным именным топонимом.