Фамилия Мартишкин, скорее всего, образована от имени Мартишка, производной формы крестильного мужского имени Мартин. Оно же в переводе с латинского языка означает «посвященный Марсу; воинственный». Одним из покровителей этого имени считается Святой Мартин, римский папа, защищавший православную веру от еретиков. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мартишка, со временем получил фамилию Мартишкин. Среди наиболее известных однофамильцев - Хризостом (в миру — Георгий Федорович Мартишкин), митрополит Виленский и Литовский.