Фамилия Мартышкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Мартышкин послужило церковное имя Мартин. Имя Мартышка (каноническая форма — Мартин) в переводе с латинского языка означает "посвященный Марсу; воинственный". Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мартышка, со временем получил фамилию Мартышкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мартышкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мартышкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.