Фамилия Марусанова — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а прозвище, образованное от глагола с яркой экспрессивной окраской. Корень «марус-» восходит к диалектному глаголу «марусить» — так в ряде русских говоров (особенно северных и сибирских) называли хмурую, пасмурную погоду, когда моросит мелкий дождь. Человек, получивший прозвище Марусан, мог быть угрюмым, нелюдимым, вечно недовольным — «как погода марусит». Впрочем, не исключено, что прозвище дали по внешности: «марусый» иногда значило «смуглый, загорелый до черноты».

Суффикс «-ан» в русских фамилиях типичен для прозвищного словообразования. Он придаёт основе оттенок простонародности, характерности: Марусан — тот, кто постоянно марусит или носит в себе эту черту. Затем к основе добавился стандартный патронимический суффикс «-ов», указывающий на принадлежность: «Марусан» → «сын Марусана» → Марусанов. Женская форма Марусанова закрепилась по правилам русской грамматики.

Географически фамилия редкая. Основные очаги бытования — Архангельская, Вологодская области, а также Забайкалье, где северные говоры смешались с сибирскими. Встречается она и у потомков староверов, переселявшихся на восток. В отличие от распространённых фамилий на «-ов» от канонических имён (Иванов, Петров), Марусанова сразу выдает нецерковное, бытовое происхождение — её носители не связаны с духовенством или дворянством, а скорее с крестьянской или мещанской средой.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к женскому имени Маруся (уменьшительное от Мария). Если бы основа была именной, фамилия звучала бы как Марусин или Марусев. Форма Марусанова однозначно указывает на прозвище — и это делает её более живой, чем многие фамилии из святцев.