Фамилия Марюхненко — яркий пример восточноукраинской модели образования фамилий. Её основа — имя Марюхна, которое в свою очередь является просторечной формой крестильного имени Мария. В украинской традиции такие имена с суффиксом -хн- (Марюхна, Палахна, Варюхна) были распространены в быту, особенно в сельской среде. Суффикс -енко, типичный для Левобережной Украины, означает «сын» или «потомок». Таким образом, Марюхненко — это «сын Марюхны», то есть человек, чей отец или дед носил это имя-прозвище.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Марю́хненко, что характерно для фамилий с этим суффиксом. В отличие от более частого суффикса -ов/-ев, -енко указывает не на принадлежность помещику, а на родство по отцу, и такие фамилии были массово распространены среди казачества и крестьянства. Марюхненко — фамилия не слишком частая, но географически привязана к центральным и восточным областям Украины (Полтавщина, Черниговщина, Слобожанщина), где подобные модели наиболее типичны.

Интересно, что имя-основа Марюхна могло иметь и более конкретный оттенок. В украинском языке слово «марюха» иногда употреблялось как ласковое обращение к женщине, но также могло быть прозвищем для мужчины, которого в шутку называли по матери. В любом случае, фамилия Марюхненко не связана с каким-либо ремеслом или профессией — это чисто патронимическая фамилия, возникшая от личного имени.

Встречаются и варианты написания — Марюхина или Марюхин, но суффикс -енко однозначно указывает на украинское происхождение. В русской среде фамилию могли адаптировать, изменив окончание на -ов, но форма Марюхненко сохранила исходную структуру. Среди носителей фамилии не зафиксировано широко известных исторических личностей, что типично для фамилий, возникших в крестьянской среде — они редко попадали в официальные хроники, но массово фиксировались в метрических книгах и ревизских сказках.