Фамилия Марзуев — редкая и с неочевидным корнем. Если отбросить типичный русский суффикс -ев (указывающий на принадлежность: «чей?» — Марзуев), остаётся основа «Марзу-». Она не встречается в древнерусских именах и прозвищах, поэтому логичнее всего искать её истоки в тюркских или кавказских языках.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с тюркским личным именем Марзу (или Марза). В ряде тюркских наречий «марза» означало «господин», «князь», «вельможа» — это слово родственно персидскому «мирза» (принц, писарь). Со временем имя Марзу могло превратиться в прозвище для уважаемого, зажиточного или властного человека, а затем — в фамилию Марзуев: «сын (или потомок) Марзу».

Другая, менее вероятная гипотеза выводит основу из арабского корня, связанного с понятием «желанный» или «просимый» (от глагола «раза» — желать). В таком случае Марзу — это вариант имени Марзук («тот, кого желают, благословенный»). Однако для фамилии Марзуев более характерна тюркская модель образования, где суффикс -ев присоединяется к основе, оканчивающейся на согласный или гласный.

Географически фамилия встречается в основном в регионах с сильным тюркским и кавказским влиянием: на Северном Кавказе (особенно в Дагестане и Чечне), в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) и среди астраханских татар. В центральной России она редка. Социально носители фамилии могли быть потомками служилых татар, торговцев или сельских старост — людей, чьё прозвище подчёркивало их статус.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих, но здесь после гласной «у» — стандартный -ев) указывает на патроним. То есть фамилия Марзуев буквально значит «принадлежащий Марзу». Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Марзу́ев, хотя в разговорной речи встречается и вариант с ударением на «а».