Фамилия Матовникова почти наверняка — фонетический вариант более распространенной фамилии Мотовникова. Такая замена гласной «о» на «а» в безударной позиции — типичное явление для русских говоров, где звук редуцируется и на письме закрепляется тот вариант, который слышится. Поэтому, анализируя происхождение, мы смотрим на исходную форму.

В основе лежит прозвище Мотовник, а оно, в свою очередь, образовано от глагола «мотать» — то есть «навертывать, навивать». Это прямое указание на ремесло: Мотовником называли того, кто занимался мотанием пряжи, наматывал нити на веретено или мотовило. Так что перед нами типичное профессиональное именование, которое закреплялось за мастером, чья работа была на виду у всей округи.

Но у глагола «мотать» есть и переносное значение — «суетиться, бегать хлопотливо туда и сюда». Это открывает вторую версию: прозвище могло отражать не род занятий, а характер. Мотовником могли окрестить человека деятельного, настойчивого, который не сидел сложа руки, а постоянно хлопотал о своих делах. Такая характеристика, данная соседями, тоже легко прилипала к человеку и заменяла ему имя.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: суффикс -ник указывает на лицо по действию или занятию (сравните: швец — швецник, плясун — плясунник), а финальное -ов/-а — стандартный русский патроним, отвечающий на вопрос «чей?». То есть изначально Матовникова — это «дочь или жена Мотовника», а позже фамилия закрепилась за всем родом. Прозвище, данное одному человеку, пережило его самого и через несколько поколений превратилось в наследственное имя его потомков.