Фамилия Мазайтис звучит не по-русски, и это ключ к её разгадке. Она принадлежит к группе литовских и латышских фамилий с характерным суффиксом -айтис (-aitis). В литовском языке этот суффикс указывает на происхождение, чаще всего — на сына или потомка. Иными словами, Мазайтис — это «сын Мазаса» или «потомок Мазаса». Основа, скорее всего, происходит от литовского слова «mazas», что означает «маленький». Таким образом, исходное прозвище Мазас давали невысокому человеку или младшему в семье, а фамилия Мазайтис закрепилась за его детьми.

Исторически такие фамилии на -айтис были распространены в Жемайтии и Аукштайтии, то есть в исконных литовских землях. В XIX веке, после отмены крепостного права, многие литовцы получили официальные фамилии, и эта модель была одной из самых продуктивных. Мазайтис — яркий пример «патронимической» фамилии, где связь с отцом или предком стоит на первом месте, а не на втором, как в русских фамилиях на -ов.

В русском языке фамилия прижилась без изменений, сохранив литовское окончание. Это отличает её от фамилий, которые русифицировали, добавляя -ов (например, Мазайтисов). Вариант Мазайтис встречается реже и указывает на то, что носители, вероятно, сохранили связь с прибалтийскими корнями или переселились в центральную Россию сравнительно поздно, уже с готовой фамилией. Ошибочно было бы искать в этой фамилии славянскую основу — её литовское происхождение почти бесспорно.