Фамилия Мегуш — редкая и неочевидная с точки зрения русского словообразования. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, которые сразу указывают на принадлежность («чей?»). Это значит, что перед нами либо фамилия, застывшая в форме прозвища или имени, либо иноязычное заимствование, которое не стали русифицировать.

Самая вероятная версия — венгерское или западнославянское происхождение. В венгерском языке есть слово «meggy» (читается как «медь») — «вишня», а суффикс -us (-уш) часто встречается в уменьшительно-ласкательных формах имён. Мегуш могло быть прозвищем человека с румяными щеками, похожими на вишню, или же производным от личного имени вроде Мегедь, Мегей. В польском и словацком языках «megusz» — возможный вариант фамилии, образованной от названия местности или ремесла, но точных параллелей в доступных словарях нет.

Вторая гипотеза связывает фамилию с южнославянскими языками, где «мегуш» может быть вариантом слова «међаш» (серб., хорв.) — «межевой», «тот, кто живёт на границе» или «владелец межевого участка». В пользу этой версии говорит то, что фамилия Мегуш встречается в Боснии и Герцеговине, Хорватии, а также у русинов Закарпатья — региона, где веками пересекались славянские и венгерские влияния.

На территории бывшей Российской империи фамилия фиксируется в основном в западных губерниях (Волынская, Подольская, Гродненская), что косвенно подтверждает её западнорусское или польско-украинское бытование. Скорее всего, предки носителей фамилии Мегуш были крестьянами или мещанами, а прозвище дали по внешнему признаку (вишнёвый румянец) или по роду занятий (межевание земли).

Однокоренных русских фамилий у Мегуша практически нет. Можно вспомнить разве что фамилию Мегедь — украинский вариант с тем же корнем, но с другим суффиксом. Такая изолированность делает фамилию хорошим маркером конкретного миграционного потока или этнической группы, например, закарпатских русинов или венгерских переселенцев.