Фамилия Мекензин — редкий случай, когда географическое название стало основой для фамилии почти без изменений. Она явно восходит к крымскому топониму Мекензи (современное название — село Каменка под Севастополем), который, в свою очередь, связан с фамилией шотландского адмирала Фомы (Томаса) Мекензи, основателя Севастополя в 1783 году. Однако носитель фамилии Мекензин — это не обязательно прямой потомок адмирала. Скорее всего, фамилию получил человек, который жил в одноимённой местности, на Мекензиевых горах или вблизи Мекензиева хутора, и был записан как «Мекензин» — то есть «тот, кто с Мекензи».

Обратите внимание на суффикс -ин. В русской ономастике он обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Мекензин, то есть «человек из владений или поселения Мекензи». Это характерно для фамилий, образованных от названий усадеб, хуторов или небольших географических объектов. Если бы фамилия происходила напрямую от прозвища по национальности (например, «шотландец»), она скорее имела бы форму Мекензиев или Мекензев — с суффиксом -ев, который типичен для фамилий от иноязычных основ, оканчивающихся на гласный. А -ин здесь говорит о том, что основа воспринималась как слово мужского рода на -а/-я: «Мекензя» или просто «Мекензи» как имя собственное.

Встречается фамилия почти исключительно в Крыму и прилегающих областях юга России. Это не массовая фамилия, а локальная, что подтверждает её привязку к конкретному месту. В дореволюционных источниках можно найти упоминания крестьян и мещан из Таврической губернии с такой фамилией — люди, вероятно, переселились с Мекензиевых хуторов в города или другие сёла, но сохранили в фамилии память о малой родине.

Спорных версий здесь немного. Иногда пытаются связать Мекензин с тюркским корнем, усматривая в нём что-то вроде «мекен» (жильё, местопребывание), но это натяжка: фамилия явно вторична по отношению к шотландскому имени Мекензи, которое через крымскую топонимику попало в русский быт. Никакого «сына Мекензи» или «потомка шотландцев» в прямом смысле тут нет — скорее всего, предок просто жил на земле, названной в честь адмирала.