Фамилия Мекертумов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти полностью скрыто за тюркскими и арабскими наслоениями. Скорее всего, её корень восходит к имени Мекертум или прозвищу Мекертум, где «Мекер» — искажённое арабское «макр» (хитрость, уловка) или тюркское «мекер» (ловкий, пронырливый). Вторая часть, «тум», может быть вариантом тюркского «тум» (род, племя) или персидского «тум» (семя, потомок). Таким образом, исходное прозвище могло означать «хитрец из рода» или «ловкий отпрыск».

Суффикс «-ов» указывает на русскую адаптацию фамилии, типичную для народов Поволжья и Кавказа, где тюркские имена переоформляли по русскому образцу в XIX–XX веках. Географически фамилия встречается в основном у кумыков, ногайцев и других тюркоязычных групп Дагестана и Ставрополья, что подтверждает её восточное происхождение. Встречаются варианты написания: Мекертумов, Мекертум-оглы (с патронимическим суффиксом) — последний сохраняет исходную тюркскую модель.

Интересно, что фамилия не разложилась на простые компоненты вроде «Мекеров» или «Тумов», а сохранила двусоставную основу. Это говорит о том, что прозвище было устойчивым и передавалось как цельное имя, а не как описание внешности или занятия. Сословно носители, скорее всего, относились к свободным крестьянам или ремесленникам — в кумыкской среде фамилии на «-ов» нередко носили даже уздени (дворяне), но без дополнительных документов определить точный статус сложно.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Мекеров, Мекерчиев) показывает, что Мекертумовы — более редкая ветвь, где корень «Мекер» не стал самостоятельной фамилией, а закрепился в составной форме. Это может указывать на то, что родоначальник был известен именно под двойным прозвищем, которое затем закрепилось как фамилия при переходе на русскую документацию.