Фамилия Меншенина — женская форма фамилии Меншенин. В русской традиции такие фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я, и указывают на принадлежность: Меншенин — «чей?» — «сын или потомок Меншени». Сама основа Меншеня — это неканоническое имя или прозвище, типичное для русских говоров.

Корень здесь — «меньш-», от прилагательного «меньший» (младший). В древнерусских семьях младшего сына или самого маленького по росту человека часто называли Меньшой, Меньшик, Менша, Меншак. Форма Меншеня — это ласкательный или уменьшительный вариант, с суффиксом -еня, который в северных и северо-западных говорах (например, в новгородских и вятских) был продуктивным для образования личных имён: вспомните фамилии Машеня, Саненя, Костеня. То есть Меншеня — это «малыш», «младшенький», «коротышка» — прозвище, данное по возрасту или росту.

По модели образования фамилия близка к Меньшикову, Меньшову, Меньшагину, но отличается именно суффиксом -еня. Этот вариант встречается реже, чем Меньшиков, и имеет более узкую географию. Судя по данным переписей и адресных книг XIX — начала XX века, носители фамилии Меншенин (и Меншенина) концентрировались в Вятской губернии (современная Кировская область) и в Пермском крае. Это подтверждает связь с севернорусским диалектным словотворчеством.

Сословно предки Меншениных, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами. Фамилии на -ин в этой среде закреплялись в XVIII–XIX веках, когда крестьянам давали фамилию по имени или прозвищу отца. Так сын Меншени становился Меншениным. Дворянских родов с такой фамилией в «Общем гербовнике» не зафиксировано, что тоже указывает на крестьянское или мещанское происхождение.

Таким образом, Меншенина — это «дочь или жена младшенького». Фамилия прямо говорит о том, что в роду был предок, которого в семье или в деревне звали уменьшительно-ласкательно Меншеня — за то, что он был младше братьев или невысок ростом.